PROTEOMICA E CITOCHINE DISTINGUONO CFSME E CONTROLLI

PROTEOMICA E CITOCHINE DISTINGUONO CFSME E CONTROLLI

I risultati di una collaborazione tra i centri Cornell e Columbia NIH,

quindi Maureen Hanson, Ian Lipkin e Mady Hornig fra i nomi noti, sono

stati pubblicati sul Journal of Translational Medicine.  L’analisi

delle proteine plasmatiche e delle citochine delle vescicole

extracellulari distingue la ME/CFS dalle persone sane con

un’accuratezza dell’86%.

L’articolo: Le analisi proteomiche e delle citochine distinguono i casi

di encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica dai controlli

(Giloteaux et al, 2023):

https://translational-medicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12967-023-04179-3

Sotto l’abstract tradotto:

Premessa

L’encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica (ME/CFS) ’ una

malattia complessa ed eterogenea caratterizzata da un affaticamento

persistente inspiegabile e da altre caratteristiche, tra cui

deterioramento cognitivo, mialgie, malessere post-sforzo e disfunzioni

del sistema immunitario. Le citochine sono presenti nel plasma e

incapsulate nelle vescicole extracellulari (EVs), ma ci sono stati solo

pochi report  sulle caratteristiche e sul carico delle EVs nella

ME/CFS. Diversi piccoli studi hanno descritto in precedenza proteine

plasmatiche o pathway proteici associati alla ME/CFS.

I metodi

Abbiamo preparato vescicole extracellulari (EVs) da campioni di plasma

congelato di una coorte di casi di encefalomielite mialgica/sindrome da

fatica cronica (ME/CFS) e di controlli con dati di citochine

plasmatiche e proteomica plasmatica precedentemente pubblicati. Il

contenuto di citochine nelle vescicole extracellulari derivate dal

plasma ’ stato determinato con un saggio multiplex e sono state

valutate le differenze tra pazienti e controlli. Abbiamo quindi

eseguito analisi statistiche multi-omiche che hanno preso in

considerazione non solo questi nuovi dati, ma anche ampi dati clinici

che descrivono la salute dei soggetti.

Risultati

I casi di ME/CFS hanno mostrato una maggiore dimensione e

concentrazione di EVs nel plasma. Le analisi del contenuto di citochine

nelle EV hanno rivelato che l’IL2 era significativamente più alta nei

casi. Abbiamo osservato numerose correlazioni tra le citochine delle

EV, tra le citochine plasmatiche e tra le proteine plasmatiche dalla

proteomica della spettrometria di massa. Correlazioni significative tra

i dati clinici e i livelli di proteine suggeriscono il ruolo di

particolari proteine e pathway nella malattia. Ad esempio, livelli più

elevati delle citochine pro-infiammatorie Granulocyte-Monocyte

Colony-Stimulating Factor (CSF2) e Tumor Necrosis Factor (TNFα) sono

stati correlati a maggiori sintomi fisici e di affaticamento nei casi

di ME/CFS. Una maggiore serina proteasi SERPINA5, coinvolta

nell’emostasi, ’ stata correlata con punteggi più alti di salute

generale SF-36 nella ME/CFS. I classificatori di apprendimento

automatico sono stati in grado di identificare un elenco di 20 proteine

in grado di discriminare tra casi e controlli, con XGBoost che ha

fornito la migliore classificazione con un’accuratezza dell’86,1% e un

valore AUROC cross-validato di 0,947. Random Forest ha distinto i casi

dai controlli con un’accuratezza del 79,1% e un valore AUROC di 0,891

utilizzando solo 7 proteine.

Conclusioni

Questi risultati si aggiungono al numero sostanziale di differenze

oggettive nelle biomolecole che sono state identificate nei soggetti

affetti da ME/CFS. Le correlazioni osservate tra proteine importanti

nella risposta immunitaria e nell’emostasi e i dati clinici implicano

ulteriormente un disturbo di queste funzioni nella ME/CFS.