BioMapAI: MODELLO CORNICE MULTI-OMICO DI AI DELLA ME/CFS
Il
dottor Derya Unutmaz ha twittato che ’ entusiasta di annunciare che il
preprint del loro importante studio sulla #MECFS; un lavoro durato 6
anni. Si tratta, tradotto, di di ’BioMapAI: Modello Cornice Multi-omico
di Intelligenza Artificiale della Encefalomielite Mialgica / Sindrome
da Fatica Cronica’
BioMapAI:
Artificial Intelligence Multi-Omics Framework Modeling of Myalgic
Encephalomyelitis / Chronic Fatigue Syndrome
Ruoyun Xiong, Elizabeth Fleming, Ryan Caldwell, Suzanne D. Vernon, Lina
Kozhaya, Courtney Gunter, Lucinda Bateman, Derya Unutmaz, Julia Oh
bioRxiv 2024.06.24.600378; doi: https://doi.org/10.1101/2024.06.24.600378
Traduzione dell’abstract:
Le malattie croniche come la MECFS e il Long -COVID presentano
un’elevata eterogeneit’ con eziologia e progressione multifattoriale,
aspetti che complicano la diagnosi e il trattamento. Per affrontare
questo problema, abbiamo sviluppato BioMapAI, un framework di Deep
Learning spiegabile che utilizza il più ricco set di dati longitudinali
multi-‘omici per la MECFS. Questo set di dati comprende la metagenomica
intestinale, il metaboloma plasmatico, il profilo immunitario, le
analisi del sangue e i sintomi clinici. Collegando i dati multinomiali
a una matrice di sintomi, BioMapAI ha identificato biomarcatori
specifici della malattia e dei sintomi, ha ricostruito i sintomi e ha
raggiunto una precisione all’avanguardia nella classificazione della
malattia. Abbiamo anche creato la prima mappa di connettivit’ di questi
dati ‘omici sia in condizioni di salute che di malattia e abbiamo
rivelato come il crosstalk microbioma-immunometaboloma si sia spostato
dalla salute alla MECFS. Abbiamo quindi proposto diverse ipotesi
meccanicistiche innovative per la MECFS: le funzioni microbiche
disturbate – SCFA (butirrato), BCAA (aminoacidi), triptofano, benzoato
– mancata connessione con i lipidi plasmatici e gli acidi biliari e
cellule infiammatorie e immunitarie della mucosa (MAIT, cellule GdT)
attivate con INFgamma; e secrezione di GzA. Queste dinamiche anomale
sono collegate ai principali sintomi della malattia, tra cui problemi
gastrointestinali, affaticamento e disturbi del sonno.
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