FIRME DI RNA CELLULARE LIBERO CIRCOLANTI
Trovate sotto l’abstract su studio uscito un mese fa circa, legato al nome di Maureen Hanson. L’articolo completo non è gratuito per tutti.
Firme di RNA cellulare libero circolante per la caratterizzazione e la diagnosi dell’encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica
A.E. Gardella,D. Eweis-LaBolle,C.J. Loy,E.D. Belcher,J.S. Lenz,C.J. Franconi,S.Y. Scofield,A. Grimson,M.R. Hanson, & I. De Vlaminck, Circulating cell-free RNA signatures for the characterization and diagnosis of myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 122 (33) e2507345122, https://doi.org/10.1073/pnas.2507345122 (2025)
Significato
L’encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica (ME/CFS) è una malattia debilitante che colpisce milioni di persone in tutto il mondo. Nonostante la crescente prevalenza della ME/CFS, i pazienti soffrono per l’indisponibilità di test diagnostici di laboratorio. In questa sede, abbiamo stabilito che l’RNA libero da cellule (cfRNA) è un bioanalita minimamente invasivo per studiare i biomarcatori circolanti e la patobiologia della ME/CFS. Utilizzando l’apprendimento automatico, sviluppiamo un modello diagnostico basato sul cfRNA con un’elevata accuratezza. Troviamo prove di disfunzione del sistema immunitario nei pazienti, con livelli elevati di trascritti derivati dalle cellule immunitarie e di pathway di segnalazione dell’infiammazione cronica. Questi risultati evidenziano il potenziale dei cfRNA circolanti per far progredire la scoperta di biomarcatori e scoprire i meccanismi di malattia della ME/CFS.
Abstract
Le persone affette da encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica (ME/CFS) fatto esperienza di sintomi eterogenei e debilitanti che mancano di una spiegazione biologica sufficiente, aggravati dall’assenza di strumenti diagnostici accurati e non invasivi. Per affrontare queste difficoltà, abbiamo esplorato l’RNA libero da cellule circolanti (cfRNA) come bioanalita ematico per monitorare la ME/CFS. Il cfRNA viene rilasciato nel flusso sanguigno durante il turnover cellulare e riflette cambiamenti dinamici nell’espressione genica, nella segnalazione cellulare e nei processi specifici dei tessuti. Abbiamo profilato il cfRNA nel plasma mediante sequenziamento dell’RNA per 93 casi di ME/CFS e 75 controlli sani e sedentari, quindi abbiamo applicato il machine learning per sviluppare modelli diagnostici e avanzare la nostra comprensione della patobiologia della ME/CFS. Un modello lineare generalizzato con regressione dell’operatore selettore a contrazione minima assoluta, addestrato sulle firme specifiche della condizione, ha raggiunto un’AUC del set di test di 0,81 e un’accuratezza del 77%. La deconvoluzione dei cfRNA immunitari ha rivelato differenze nei cfRNA di derivazione piastrinica tra casi e controlli, nonché livelli elevati di cfRNA di derivazione plasmacitoide dendritica, monocitaria e di cellule T nella ME/CFS. L’analisi della rete biologica ha ulteriormente implicato la disfunzione immunitaria nella ME/CFS, con firme di segnalazione delle citochine e di esaurimento delle cellule T. Questi risultati dimostrano l’utilità della biopsia liquida dell’RNA come strumento minimamente invasivo per svelare la complessa biologia alla base delle malattie croniche.
