VERSO UN MODULO DI MALATTIA PER LA ME/CFS
Per ora ’ un pre-print e non peer-reviewed, ma ’ uscito ieri un
articolo del ’nostro’ Paolo Maccallini: ’Verso un modulo di malattia
per la ME/CFS: una prioritizzazione dei geni network-based’
Maccallini P., Toward a Disease Module for ME/CFS: A Network-Based Gene
Prioritization, medRxiv 2025.04.13.25325733; doi: https://doi.org/10.1101/2025.04.13.25325733
Traduzione dell’abstract:
Premessa: L’encefalomielite mialgica/sindrome da fatica cronica
(ME/CFS) ’ una patologia debilitante con un’eziologia non chiara e
nessun trattamento approvato dalla FDA. Studi recenti suggeriscono un
possibile contributo genetico alla sua patogenesi.
Obiettivo: Questo studio mira a identificare i geni candidati per la
ME/CFS utilizzando sia l’evidenza empirica di studi di che prendono in
considerazione tutto il genoma e sequenziamento di prossima generazione
su casi monogenici, sia l’espansione computazionale basata sui network
di interazione proteina-proteina.
Metodi: dalla letteratura rilevante sono stati identificati ventidue
geni associati alla ME/CFS, includendo sia varianti comuni che rare.
Questi geni sono stati utilizzati come semi nel database STRING per
recuperare geni interagenti ad alta confidenza. Un algoritmo Random
Walk with Restart (RWR) ha classificato 1063 geni candidati in base
alla loro somiglianza con i semi. I primi 250 geni classificati sono
stati selezionati per definire un modulo di malattia denominato modulo
ME/CFS. Questo modulo ’ stato analizzato per verificare l’arricchimento
nelle vie metaboliche e le associazioni con la malattia.
Risultati: L’analisi dell’arricchimento ha identificato sovrapposizioni
significative con il metabolismo e la segnalazione degli sfingolipidi e
con le vie legate all’energia. Anche la degradazione dell’eme, i geni
metabolici regolati da TP53 e la termogenesi sono stati identificati
come possibili fattori che contribuiscono alla patogenesi della ME/CFS.
Sono state osservate sovrapposizioni con malattie metaboliche e
neurodegenerative.
Conclusioni: Il modulo ME/CFS coglie i meccanismi biologicamente
plausibili alla base della ME/CFS, con particolare attenzione al
metabolismo lipidico ed energetico. Fornisce inoltre uno strumento per
filtrare i dati dell’esoma e del genoma per lo studio dei casi
mendeliani di ME/CFS.
